Class BlatResultValueObject

    • Method Detail

      • hashCode

        public int hashCode()
        Overrides:
        hashCode in class Object
      • getBlockCount

        public Integer getBlockCount()
      • setBlockCount

        public void setBlockCount​(Integer blockCount)
      • getBlockSizes

        public String getBlockSizes()
      • setBlockSizes

        public void setBlockSizes​(String blockSizes)
      • getIdentity

        public Double getIdentity()
      • setIdentity

        public void setIdentity​(Double identity)
        Parameters:
        identity - the identity to set (0-1)
      • getMatches

        public Integer getMatches()
      • setMatches

        public void setMatches​(Integer matches)
      • getMismatches

        public Integer getMismatches()
      • setMismatches

        public void setMismatches​(Integer mismatches)
      • setNs

        public void setNs​(Integer ns)
      • getQueryEnd

        public Integer getQueryEnd()
      • setQueryEnd

        public void setQueryEnd​(Integer queryEnd)
      • getQueryGapBases

        public Integer getQueryGapBases()
      • setQueryGapBases

        public void setQueryGapBases​(Integer queryGapBases)
      • getQueryGapCount

        public Integer getQueryGapCount()
      • setQueryGapCount

        public void setQueryGapCount​(Integer queryGapCount)
      • setQuerySequence

        public void setQuerySequence​(BioSequenceValueObject querySequence)
        Parameters:
        querySequence - the querySequence to set
      • getQueryStart

        public Integer getQueryStart()
      • setQueryStart

        public void setQueryStart​(Integer queryStart)
      • getQueryStarts

        public String getQueryStarts()
      • setQueryStarts

        public void setQueryStarts​(String queryStarts)
      • getRepMatches

        public Integer getRepMatches()
      • setRepMatches

        public void setRepMatches​(Integer repMatches)
      • getScore

        public Double getScore()
      • setScore

        public void setScore​(Double score)
      • getStrand

        public String getStrand()
      • setStrand

        public void setStrand​(String strand)
      • getTargetChromosomeName

        public String getTargetChromosomeName()
      • setTargetChromosomeName

        public void setTargetChromosomeName​(String targetChromosomeName)
      • getTargetDatabase

        public String getTargetDatabase()
      • setTargetDatabase

        public void setTargetDatabase​(String targetDatabase)
      • getTargetEnd

        public Long getTargetEnd()
      • setTargetEnd

        public void setTargetEnd​(Long targetEnd)
      • getTargetGapBases

        public Integer getTargetGapBases()
      • setTargetGapBases

        public void setTargetGapBases​(Integer targetGapBases)
      • getTargetGapCount

        public Integer getTargetGapCount()
      • setTargetGapCount

        public void setTargetGapCount​(Integer targetGapCount)
      • getTargetStart

        public Long getTargetStart()
      • setTargetStart

        public void setTargetStart​(Long targetStart)
      • getTargetStarts

        public String getTargetStarts()
      • setTargetStarts

        public void setTargetStarts​(String targetStarts)